Qu’est-ce que la métabolomique ? et la métabolomique prédictive ?

Grâce aux experts et chercheurs INRAE du Pôle METABOLOME de BORDEAUX, un groupe d'agriculteurs a pu découvrir que l'INRAE et d'autres confrères effectuent des travaux intéressants pour leur avenir et leur métier .

Merci à l'INRAE pour cette présentation du 21 Mai 2025 dans le 51

"La métabolomique est l’étude exhaustive des métabolites, ces petites molécules produites ou utilisées par les êtres vivants (plantes, animaux, micro-organismes). Elle vise à identifier et quantifier ces substances dans des tissus ou organismes. Lorsqu’on se concentre sur les lipides, on parle de "lipidomique".
🌿 Utilité pour l’agriculture
La métabolomique végétale offre de nombreuses applications utiles aux agriculteurs et conseillers agricoles :
Évaluer la qualité nutritionnelle des aliments.
Détecter des molécules bioactives (défense contre les maladies, résistance au stress comme la sécheresse ou le froid).
Améliorer les variétés agricoles : en associant certains métabolites à des marqueurs génétiques, on peut sélectionner des plantes plus performantes.
Faire du diagnostic rapide et non invasif grâce à des empreintes métaboliques (fingerprinting).
Contribuer à une biologie intégrative en combinant les données métabolomiques avec d’autres données biologiques (génomique, transcriptomique, etc.).
🔬 Méthodes utilisées
Deux technologies principales sont utilisées :
Résonance Magnétique Nucléaire (RMN) : fiable pour quantifier les métabolites et analyser leur structure.
Spectrométrie de Masse (MS), couplée à la chromatographie : plus sensible et capable de détecter des milliers de métabolites.
Approches :
Non ciblée : exploration large sans hypothèse préalable, mais exigeante et lente.
Ciblée : mesure rapide de métabolites spécifiques à très faible concentration.
Haut débit : automatisation via microplaques pour tester des centaines d’échantillons en parallèle.
🧪 Analyse structurale et modélisation
L’analyse des structures 3D des métabolites (via RMN bidimensionnelle + modélisation moléculaire) est essentielle pour comprendre leur rôle biologique.
Vers une agriculture de précision
Grâce à la métabolomique, les professionnels de l’agriculture pourront bientôt :
Identifier les variétés les plus robustes ou nutritives.
Optimiser les intrants (eau, engrais) en fonction du profil métabolique des plantes.
Mieux anticiper les réactions des cultures aux conditions environnementales"